<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1387</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2008</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>2</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>ارزیابی ارتباط ژن وابسته به سیتوتوکسین (cagA) با اختلالات گوارشی در مبتلایان به عفونت هلیکوباکتر پیلوری</title_fa>
	<title>Assessment the relationship ofcagAgene with different gastroduodenal diseases in Helicobacter pyloriinfected patients</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div align=&quot;right&quot; style=&quot;direction: rtl&quot;&gt;
&lt;b&gt;زمینه و اهداف:&lt;/b&gt; &lt;i&gt;هلیکوباکتر پیلوری&lt;/i&gt; عامل التهاب معده و زخم های گوارشی و عامل خطر ایجاد آدنوکارسینومای معده به شمار می آید. ژن وابسته به سیتوتوکسین cagA A یکی از مهمترین شاخص های بیماریزایی این باکتری می باشد که به دلیل تنوع ژنتیکی در نواحی جغرافیایی مختلف از اهمیت خاصی برخوردار می باشد. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی ژن مذکور در بیماران دچار اختلالات گوارشی و ارزیابی آن به منظور غربالگری بیماران در معرض خطر بالا می باشد.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;روش بررسی:&lt;/b&gt; در این مطالعه 180 بیمار دچار اختلالات گوارشی مراجعه کننده به بخش اندوسکوپی بیمارستان امیر اعلم یا انستیستو کانسر شهر تهران وارد مطالعه شدند. از میان 120 بیماری که هلیکوباکتر پیلوری از آنها جدا شد، 81 بیمار دچار سوء هاضمه بدون زخم، 17 بیمار دچار زخم گوارشی و 22 بیمار مبتلا به سرطان معده بودند. پس از کشت، جداسازی باکتری و استخراج ژنوم جستجوی ناحیه حفاظت شده ژن وابسته به سیتوتوکسین با استفاده از PCR انجام شد. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از آزمون مجذور کای انجام شد.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;یافته ها:&lt;/b&gt; 120 سویه هلیکوباکتر پیلوری از 180 بیمار مورد بررسی جدا شد. از میان 120 سویه مورد بررسی، 101 سویه cagA)%84.2) مثبت بودند و 19 سویه باقیمانده cagA) %15.8) منفی بودند. تمام بیماران دچار سرطان معده سویه های cagA مثبت را حمل می کردند و وجود این ژن با سرطان معده در مقایسه با بیماران دچار سوء هاضمه بدون زخم، ارتباط معنی داری را نشان داد. در عین حال با سایر اشکال بالینی اختلاف معنی داری مشاهده نشد.
&lt;b&gt;نتیجه گیری: &lt;/b&gt;به دلیل پراکندگی یکنواخت ژن cagA در بیماران دارای علایم بالینی متفاوت، بررسی حضور ژن cagA به تنهایی نمی تواند به عنوان شاخص تعیین کننده برای یک پیامد بالینی ناشی از عفونت &lt;i&gt;هلیکوباکتر پیلوری&lt;/i&gt; باشد
&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;b&gt;Background and objectives:&lt;/b&gt; The gastric pathogen &lt;i&gt;Helicobacter pylori i&lt;/i&gt;s introduced as an etiologic agent of 
gastritis and peptic ulcer and is associated with development of gastric adenocarcinoma. One of the most 
studied virulence marker of &lt;i&gt;H. pylori i&lt;/i&gt;s cytotoxin-associated gene A (cagA) with significant geographical 
heterogeneity around the world. This study was undertaken to assess the status of cagA gene of &lt;i&gt;H .pylori&lt;/i&gt;
strains infecting Iranian patients suffering from various gastrointestinal diseases and to evaluate the detection 
of this gene as a screening marker of high-risk patients.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Material and Methods:&lt;/b&gt; In this study, 180 patients (Mean age: 44 years) with upper gastrointestinal 
manifestations referred for endoscopy to Amir-Alam Hospital or Cancer Institute in Tehran were included. 
Among one hundred twenty &lt;i&gt;H. pylori i&lt;/i&gt;nfected patients 81, 17 and 22 had non–ulcer dyspepsia (NUD), peptic 
ulcer disease (PUD), and gastric carcinoma (GC) respectively. Tissue samples were homogenized and 
incubation was performed up to 5 days. Identification was based on morphology under Gram staining and 
biochemical tests. The status of conserved region of cagA gene was determined by gene specific PCR. For 
statistical analysis, χ2 test was used. 
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Results:&lt;/b&gt; Among the 180 of studied patients, 120 &lt;i&gt;H. pylori&lt;/i&gt; strains were isolated. One hundred and one 
(84.2%) of the tested strains were positive for cagAand the remaining strains (15.8%) were negative. All of 
gastric cancer cases were infected with cagA-positive strains. The cagA-positive strains were significantly 
associated with GC as compared with NUD (p &lt; 0.05) but this association did not gain statistical significance 
for other clinical outcomes.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Conclusion: &lt;/b&gt;Although the possession of cagA is associated with GC when compared to NUD, due to the 
uniform distribution of cagA in all other disease categories detection of cagA alone can not be considered as 
a discriminative marker for a specific clinical outcome. Hence, the study ofother virulence determinants and 
functional characteristics of cagA gene might be necessary for screening high risk patient
</abstract>
	<keyword_fa>سیتوتوکسین، cagA، اختلالات گوارشی</keyword_fa>
	<keyword>Cytotoxin-associated gene A, Gastric cancer, Peptic ulcer</keyword>
	<start_page>31</start_page>
	<end_page>36</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-86&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Masomeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Douraghi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>معصومه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>دورقی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600474</code>
	<orcid>1003194753284600474</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Deptartment of Pathobiology, School of PublicHealth, Medical Sciences/University of Tehran</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش باکتری شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Marjan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mohammadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مرجان</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>محمدی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600475</code>
	<orcid>1003194753284600475</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Shirazi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدحسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>شیرازی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mhshirazi@sina.tums.ac.ir</email>
	<code>1003194753284600476</code>
	<orcid>1003194753284600476</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Esmaili</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اسماعیلی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600477</code>
	<orcid>1003194753284600477</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Maryam</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bababeik</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مریم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بابابیک </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600478</code>
	<orcid>1003194753284600478</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Samaneh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Saberi Kashani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمانه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صابری کاشانی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600479</code>
	<orcid>1003194753284600479</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Akbar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Oghalaie</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>اکبر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عقلایی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600480</code>
	<orcid>1003194753284600480</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Nazanin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mohajerani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نازنین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهاجرانی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600481</code>
	<orcid>1003194753284600481</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Helicobacter pylori Research Group, Biotechnology Research Center, Pasteur Institute of Iran, Tehran </affiliation>
	<affiliation_fa>گروه تحقیقات هلیکوباکتر، بخش بیوتکنولوژی، انیستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
