<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Iranian Journal of Medical Microbiology</title>
<title_fa>مجله میکروب شناسی پزشکی ایران</title_fa>
<short_title>Iran J Med Microbiol</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://ijmm.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-8612</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2345-4342</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii>8</journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.30699/ijmm</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1386</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2008</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>1</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص باکتری های استاندارد عامل عفونت های ادراری با استفاده از پرایمرهای فراگیر</title_fa>
	<title>Molecular Detection of bacterial pathogens involved in urinary tract infection</title>
	<subject_fa>باکتری شناسی پزشکی </subject_fa>
	<subject>Medical Bacteriology</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Original Research Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div align=&quot;right&quot; style=&quot;direction: rtl&quot;&gt;
&lt;b&gt;زمینه و اهداف:&lt;/b&gt; عفونت ادراری (UTI) یکی از شایعترین عفونت ها به ویژه در بیماران بستری در بیمارستان می باشد. امروزه روش معمول و استاندارد در تشخیص عوامل باکتریایی ایجاد کننده عفونت های فوق، کشت ادرار می باشد. شناسایی و ردیابی عوامل پاتوژن فوق، به کمک روش های مولکولی منجر به سرعت و دقت در تشخیص عفونت می گردد. پژوهش حاضر به منظور طراحی روشی مولکولی در تشخیص عفونت های ادراری ناشی از عوامل باکتریایی صورت گرفته است.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;روش بررسی:&lt;/b&gt; بدین منظور گونه های شایع و استاندارد باکتریایی موثر در عفـونت های ادراری تهیه گردید و استخراج DNA ژنـومـی در آنهـا صـورت گرفت. بـا استفـاده از روش PCR و بـه کمـک پرایمرهای فراگیر قطعه ای از 16S rDNA تکثیر گردید و الگوهای ویژه هر باکتری استاندارد توسط هضم آنزیمی به کمک دو آنزیم محدودگر Hae III و Alu I شناسایی گردید.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;یافته ها:&lt;/b&gt; الگوهای فوق از گونه ای به گونه ای دیگر کاملا متمایز بودند. بدین ترتیب الگوی هضم آنزیمی قطعات 16S rDNA باکتری های &lt;i&gt;اشریشیاکلی&lt;/i&gt;، &lt;i&gt;کلبسیلا پنومونیه&lt;/i&gt;، &lt;i&gt;استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس&lt;/i&gt;، &lt;i&gt;استافیلوکوکوس اورئوس&lt;/i&gt;، &lt;i&gt;پسودوموناس آئروژینوزا&lt;/i&gt;، و &lt;i&gt;پروتئوس میرابیلیس&lt;/i&gt; کاملا متمایز از یکدیگر در ژل الکتروفورز دیده شدند.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;نتیجه گیری:&lt;/b&gt; با توجه به الگوهای فوق شاید بتوان باکتری های پاتوژن را در نمونه های ادراری عفونی با سرعت بیشتر و دقت لازم شناسایی نمود.
&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;b&gt;Background and Objectives:&lt;/b&gt; Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infections and a 
major cause of patient morbidity world wide. The gold standard for detection of bacterial pathogens in 
UTI is culture of urine specimens. In order to facilitate identification of bacterial pathogens in clinical urine 
specimens we designed a molecular method to detect bacterial pathogen in UTI.
&lt;br&gt;&lt;b&gt;Material and Methods:&lt;/b&gt; The genomic DNA of standard bacterial pathogens involved in UTI were extracted. 
Based on the 16S rDNA, the universal primers were designed and the amplification of the fragments was 
carried out. The enzymatic digestions were performed by two restriction enzymes (HaeIII and AluI) to 
produce a specific pattern for bacteria as follow &lt;i&gt;E. coli&lt;/i&gt;, &lt;i&gt;K. pneumoniae&lt;/i&gt;, &lt;i&gt;S. saprophyticus&lt;/i&gt;, &lt;i&gt;S. aureus&lt;/i&gt;, &lt;i&gt;P. 
aeruginosa &lt;/i&gt;and&lt;i&gt; P. mirabilis&lt;/i&gt;. 
Results: Although the size of the PCR products were not quite changed in different species, but the pattern 
of digestion is exclusive. The polyacrylamide gel electrophoresis showed a significant differentiations bands. &lt;br&gt;
&lt;b&gt;Conclusion:&lt;/b&gt; The digestion pattern can be used as a standard for identification of bacterial pathogens 
involved in UTI
</abstract>
	<keyword_fa>UTI, Universal Primers, PCR, RFLP</keyword_fa>
	<keyword>UTI, Universal Primers, PCR, RFLP</keyword>
	<start_page>41</start_page>
	<end_page>45</end_page>
	<web_url>http://ijmm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-77&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Homan</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sedghian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>هومن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>صدیقیان </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>1003194753284600376</code>
	<orcid>1003194753284600376</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Urology Research Center, Sina Hospital, Tehran University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammadreza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Pourmand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پورمند </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mpourmand@tums.ac.ir</email>
	<code>1003194753284600377</code>
	<orcid>1003194753284600377</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>بخش میکروب شناسی، گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
