%0 Journal Article %A Dariushnejad, Hassan %A Ghorbanzadeh, Vajihe %A Akbari, Soheila %A Hashemzadeh, Pejman %T Designing a Multi-epitope Peptide Vaccine Against COVID-19 Variants Utilizing In-silico Tools %J Iranian Journal of Medical Microbiology %V 15 %N 5 %U http://ijmm.ir/article-1-1390-fa.html %R 10.30699/ijmm.15.5.592 %D 2021 %K B1.1.7 variant, COVID-19, Immunoinformatics, SARS-CoV-2, Vaccine, %X سابقه و هدف: SARS-CoV-۲ عامل بیماری کروناویروس ۲۰۱۹ یا کوید-۱۹ در جهان است. بیماری کروناویروس جدید یک بیماری تنفسی است. تا به امروز ، چالش هایی در درمان کوید-۱۹ وجود داشته و واریانت های جدیدی مانند B۱.۱.۷ UK ظاهر شده است. بر این اساس ، یک رژیم پیشگیری موثر برای این عفونت مورد نیاز است، که بیشتر واریانت های آن را پوشش می دهد. هدف از این تحقیق پیش بینی اپی توپ های محافظت شده اسپایک پروتئین و پروتئین نوکلئوکپسید از SARS-CoV-۲ برای طراحی واکسن مولتی اپی توپ علیه واریانت های کوید-۱۹ با استفاده از ابزارهای رایانه ای می باشد. روش: تجزیه و تحلیل محاسباتی و رویکردهای ایمونو انفورماتیک شامل شناسایی اپی توپ های محافظت شده بلقوه و انتخاب اپی توپ ها بر اساس آلرژنسیتی ، توکسیسیتی ، آنتی ژنسیتی و داکینگ مولکولی برای پیش بینی و غربالگری اپی توپ ها است. در مرحله بعد، بخشهای منتخب از اپیتوپ ها توسط لینکرهای مناسب متصل شدند. در نهایت، پروتئین متصل به مالتوز (MBP) به عنوان یک ادوجوانت به ساختار واکسن جدید اضافه شد. ساختارهای ثانویه و سوم واکسن مولتی اپی توپ طراحی شده از طریق الگوریتم های ایمونوانفورماتیک پیش بینی شد. ساختار پیش بینی شده برای دستیابی به بهترین پایداری تصفیه معتبر شده است. در پایان، ارزیابی ایمونو انفورماتیک، داکینگ مولکولی و پویایی مولکولی به منظور تایید کارایی واکسن انجام شد. بهینه سازی کدون و شبیه سازی رایانه ای برای اطمینان از عملکرد بیان واکسن مولتی اپی توپ جدید در میزبان هدف انجام شد. نتایج: این مطالعه نشان داد که داده های ما این پیشنهاد را تایید می کند که واکسن طراحی شده ما می تواند پاسخ های ایمنی را در برابر واریانت های SARS-CoV-۲ ایجاد کند. نتیجه گیری: ساختار طراحی شده با بررسی نرم افزارها دارای کیفیت قابل قبولی بود. آزمایشهای در شرایط آزمایشگاهی و در محیط درونی بدن موجود زنده برای تأیید ایمنی و ایمنی زایی واکسن کاندید مورد نیاز است. %> http://ijmm.ir/article-1-1390-fa.pdf %P 592-605 %& 592 %! Recombinant vaccine for COVID-19 Variants %9 Original Research Article %L A-10-1648-1 %+ Department of Medical Biotechnology, Faculty of Medicine, Lorestan University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran %G eng %@ 1735-8612 %[ 2021