سال 16، شماره 5 - ( مهر - آبان 1401 )
جلد 16 شماره 5 صفحات 489-488 |
برگشت به فهرست نسخه ها
1- گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فنون پیشرفته، علوم پزشکی تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران ، mostafa_noorizadeh@yahoo.com
2- مرکز تحقیقات بیماری‌های تنفسی مزمن، پژوهشکده ملی سل و بیماری‌های ریوی (NRITLD)، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
2- مرکز تحقیقات بیماری‌های تنفسی مزمن، پژوهشکده ملی سل و بیماری‌های ریوی (NRITLD)، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
چکیده: (1127 مشاهده)
SARS-CoV-۲ از خانواده ی کرونا ویروس ها است که موجب ایجاد COVID-۱۹ که برای اولین بار در سال ۲۰۱۹ (گروه مطالعاتی Coronaviridae کمیته بین المللی طبقه بندی ویروس ها) در ووهان از چین شناسایی شد می شود. Omicron یکی از واریانت های SARS-CoV-۲ می باشد که اولین بار در ۲۴ نوامبر ۲۰۲۱ از طریق شبکه ژنومیکس آقریقای جنوبی به WHO (بهداشت جهانی) اطلاع داده شد(۱). Omicron ابتدا در بوتسوانا شناسایی شد و سپس در کل دنیا پخش شد و به واریانت غالب تبدیل شد(۲). بعد از BA.۱ (واریانت اصلی Omicron) چندین زیر سویه omicron، مانند BA.۲، BA.۳، BA.۴، و BA.۵ نیز شناسایی شد(۳). زیر سویه های BA.۴ و BA.۵ توسط VTG به عنوان V-۲۲APR-۰۳ و V-۲۲APR-۰۴ طبقه بندی شد. جهش هایی که در پروتیین سنبله BA.۴ هستند عبارتند از: NSP۴: L۴۳۸ (WT، wildtype)؛ S: حذف ۶۹/۷۰، L۴۵۲R، F۴۸۶V، Q۴۹۳ (WT); ORF ۷b: L۱۱F; N: P۱۵۱S و S حذف ۷۰/۶۹. همه ی جهش های BA.۵ مشابه جهش های BA.۴ هستند و تفاوت هایی که وجود دارد عبارتند از : M: D۳N; ORF ۶: D۶۱ (WT)؛ ORF ۷b: L۱۱ (WT); N: P۱۵۱ (WT); SNP های مترادف: A۲۷۰۳۸G و C۲۷۸۸۹T (۴).
برخی از مردم اعتقادشان بر این است که از آنجایی که جهش هایی در زیر سویه های جدید ایجاد شده است پس واکسن ها بی اثر هستند و به همین خاطر از تزریق دوز بوستر امتناع می کنند. این مطالعه با هدف بررسی جهش های Ba.۴ و BA.۵ با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی انجام شده است. از آنجایی که برخی از واکسن های مورد استفاده در حال حاضر RBD را هدف قرار می دهند (Receptor Binding Domain). در این تحقیق جهش های RBD مورد بررسی قرار گرفت. نتایج به دست آمده از تجزیه و تحلیل نشان داد که حداقل پنج اپیتوپ با امتیاز بالا مر بوط به سلول B وجود دارد که بدون تغییر باقی مانده است(شکل ۱) (۵). تجزیه و تحلیل اپی توپ های سلول T نشان داد که هنوز تعداد زیادی از اپیتوپ ها بدون تغییر باقی مانده است (بسیاری ازHLA-A، HLA-B و HLA-C). نتایج تحلیل و بررسی های بوجود آمده نشان می دهد که واکسن های مورد استفاده می توانند سیستم ایمنی را علیه زیر سویه های جدید نیز تحریک کنند و موجب تقویت ایمنی سلولی و ایمنی همورال شده و در ممانعت از بستری و مرگ نقش موثری داشته باشند.
برخی از مردم اعتقادشان بر این است که از آنجایی که جهش هایی در زیر سویه های جدید ایجاد شده است پس واکسن ها بی اثر هستند و به همین خاطر از تزریق دوز بوستر امتناع می کنند. این مطالعه با هدف بررسی جهش های Ba.۴ و BA.۵ با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی انجام شده است. از آنجایی که برخی از واکسن های مورد استفاده در حال حاضر RBD را هدف قرار می دهند (Receptor Binding Domain). در این تحقیق جهش های RBD مورد بررسی قرار گرفت. نتایج به دست آمده از تجزیه و تحلیل نشان داد که حداقل پنج اپیتوپ با امتیاز بالا مر بوط به سلول B وجود دارد که بدون تغییر باقی مانده است(شکل ۱) (۵). تجزیه و تحلیل اپی توپ های سلول T نشان داد که هنوز تعداد زیادی از اپیتوپ ها بدون تغییر باقی مانده است (بسیاری ازHLA-A، HLA-B و HLA-C). نتایج تحلیل و بررسی های بوجود آمده نشان می دهد که واکسن های مورد استفاده می توانند سیستم ایمنی را علیه زیر سویه های جدید نیز تحریک کنند و موجب تقویت ایمنی سلولی و ایمنی همورال شده و در ممانعت از بستری و مرگ نقش موثری داشته باشند.
نوع مطالعه: نامه به سردبیر |
موضوع مقاله:
ویروس شناسی پزشکی
دریافت: 1401/5/11 | پذیرش: 1401/5/31 | انتشار الکترونیک: 1401/6/1
دریافت: 1401/5/11 | پذیرش: 1401/5/31 | انتشار الکترونیک: 1401/6/1
فهرست منابع
1. Quarleri J, Galvan V, Delpino MV. Omicron variant of the SARS-CoV-2: a quest to define the consequences of its high mutational load. Geroscience. 2022;44(1):53-6. [DOI:10.1007/s11357-021-00500-4] [PMID] [PMCID]
2. Gowrisankar A, Priyanka TMC, Banerjee S. Omicron: a mysterious variant of concern. Eur Phys J Plus. 2022;137(1):100. [DOI:10.1140/epjp/s13360-021-02321-y] [PMID] [PMCID]
3. Yao L, Zhu KL, Jiang XL, Wang XJ, Zhan BD, Gao HX, Geng XY, Duan LJ, Dai EH, Ma MJ. Omicron subvariants escape antibodies elicited by vaccination and BA.2.2 infection. Lancet Infect Dis. 2022 Aug;22(8):1116-7. [DOI:10.1016/S1473-3099(22)00410-8]
4. UK health security agency. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England. Technical briefing. 2022.
5. Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol. 2020 Apr;5(4):536-44. [DOI:10.1038/s41564-020-0695-z] [PMID] [PMCID]
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |