سال 13، شماره 3 - ( مرداد - شهریور 1398 )
جلد 13 شماره 3 صفحات 174-164 |
برگشت به فهرست نسخه ها
فاطمه ثامنی1 
، مهرناز شاهبیک1 ، حسین دبیری 2
، مهرناز شاهبیک1 ، حسین دبیری 2
1- گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم و فناوری‌های نوین، واحد علوم دارویی دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
2- گروه میکروب‌شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران ، hodabiri@gmail.com
2- گروه میکروب‌شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران ، hodabiri@gmail.com
چکیده: (4934 مشاهده)
زمینه و هدف: پیلی تیپIV یک فاکتور کلونیزاسیون مهم برای پاتوژن فرصت طلب سودوموناس آئروژینوزا است، که در شکل گیری بیوفیلم و اتصال به سلولهای میزبان نقش دارد. هر تیپ پیلی با یک ژن کمکی خاص کد می شود. از این رابطه ی مشخص میتوان به عنوان یک هدف درمانی برای تشخیص سویه های سودوموناس آئروژینوزا و همچنین تیپ بندی مولکولی آن استفاده کرد. هدف این مطالعه ارزیابی فراوانی تیپهای مختلف ژنهای کمکی در نمونه های فیبروز سیستیک(CF) ، سوختگی و محیطی می باشد.
مواد و روشها: نمونه های سودوموناس آئروژینوزا از بیمارانCF ، سوختگی و همچنین پسماندهای محیطی در طی سال 95-94، جمع آوری گردید. نمونه ها با استفاده از روشهای استاندارد میکروبی و بیوشیمیایی کشت داده و شناسایی شد. استخراجDNA توسط جوشاندن انجام شد وPCR از طریق پرایمرهای اختصاصی انجام شد.
یافته ها: روی هم رفته 90 ایزوله ی سودوموناس آئروژینوزا( 35 نمونه محیطی، 30 نمونه سوختگی و 25 نمونه(CF مورد بررسی قرار گرفتTfpO . وTfpZ به ترتیب در 71 و 2 ایزوله مثبت بودند.
نتیجه گیری: براساس نتایج بدست آمده ما نشان دادیم که تیپ پیلی سودوموناس آئروژینوزا بسیار متنوع است. صرف نظر از منبع نمونه ها، شایعترینTfp ،TfpO بود. با در نظر گرفتن این واقعیت کهTfpZ فقط در نمونه های سوختگی دیده شد، میتوان فرض کرد این تیپ خاص ممکن است در شرایط حاد بالینی ظاهر شود. در نهایت انجام این مطالعه بر جامعه ی آماری بزرگتر و بهره گیری از روشهای جامعتر تایپینگ را پیشنهاد میکنیم.
مواد و روشها: نمونه های سودوموناس آئروژینوزا از بیمارانCF ، سوختگی و همچنین پسماندهای محیطی در طی سال 95-94، جمع آوری گردید. نمونه ها با استفاده از روشهای استاندارد میکروبی و بیوشیمیایی کشت داده و شناسایی شد. استخراجDNA توسط جوشاندن انجام شد وPCR از طریق پرایمرهای اختصاصی انجام شد.
یافته ها: روی هم رفته 90 ایزوله ی سودوموناس آئروژینوزا( 35 نمونه محیطی، 30 نمونه سوختگی و 25 نمونه(CF مورد بررسی قرار گرفتTfpO . وTfpZ به ترتیب در 71 و 2 ایزوله مثبت بودند.
نتیجه گیری: براساس نتایج بدست آمده ما نشان دادیم که تیپ پیلی سودوموناس آئروژینوزا بسیار متنوع است. صرف نظر از منبع نمونه ها، شایعترینTfp ،TfpO بود. با در نظر گرفتن این واقعیت کهTfpZ فقط در نمونه های سوختگی دیده شد، میتوان فرض کرد این تیپ خاص ممکن است در شرایط حاد بالینی ظاهر شود. در نهایت انجام این مطالعه بر جامعه ی آماری بزرگتر و بهره گیری از روشهای جامعتر تایپینگ را پیشنهاد میکنیم.
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی |
موضوع مقاله:
باکتری شناسی پزشکی
دریافت: 1398/2/24 | پذیرش: 1398/6/2 | انتشار الکترونیک: 1398/9/1
دریافت: 1398/2/24 | پذیرش: 1398/6/2 | انتشار الکترونیک: 1398/9/1
فهرست منابع
1. McCallum M, Tammam S, Little DJ, Robinson H, Koo J, Shah M, et al. PilN Binding Modulates the Structure and Binding Partners of the Pseudomonas aeruginosa Type IVa Pilus Protein PilM. Journal of biological Chemistry. 2016: 291, 11003-11015. [DOI:10.1074/jbc.M116.718353] [PMID] [PMCID]
2. Buensuceso RN, Daniel-Ivad M, Kilmury SL, Leighton TL, Harvey H, Howell PL, et al. Cyclic AMP-Independent Control of Twitching Motility in Pseudomonas aeruginosa. Journal of bacteriology. 2017; 199(16):e00188-17. [DOI:10.1128/JB.00188-17] [PMID] [PMCID]
3. Ortega DR, Fleetwood AD, Krell T, Harwood CS, Jensen GJ, Zhulin IB. Assigning chemoreceptors to chemosensory pathways in Pseudomonas aeruginosa. PNAS. 2017: 114 (48) 12809-12814. [DOI:10.1073/pnas.1708842114] [PMID] [PMCID]
4. Gold VA, Salzer R, Averhoff B, Kühlbrandt W. Structure of a type IV pilus machinery in the open and closed state. Elife. 2015; 4:e07380. [DOI:10.7554/eLife.07380] [PMID] [PMCID]
5. Leighton TL, Mok MC, Junop MS, Howell PL, Burrows LL. Conserved, unstructured regions in Pseudomonas aeruginosa PilO are important for type IVa pilus function. Scientific reports. 2018; 8:2600. [DOI:10.1038/s41598-018-20925-w] [PMID] [PMCID]
6. Tan RM, Kuang Z, Hao Y, Lee F, Lee T, Lee RJ, Lau GW. Type IV Pilus Glycosylation Mediates Resistance of Pseudomonas aeruginosa to Opsonic Activities of the Pulmonary Surfactant Protein A. Infection and Immunity 2015; 83(4): 1339-46. [DOI:10.1128/IAI.02874-14] [PMID] [PMCID]
7. Kus JV, Tullis E, Cvitkovitch DG, Burrows LL. Significant differences in type IV pilinallele distribution among Pseudomonas aeruginosa isolates from cystic fibrosis (CF) versus non-CF patients. Microbiology. 2004;150(Pt 5):1315-26. [DOI:10.1099/mic.0.26822-0] [PMID]
8. Smedley JG, 3rd, Jewell E, Roguskie J, Horzempa J, Syboldt A, Stolz DB, et al. Influence of pilin glycosylation on Pseudomonas aeruginosa 1244 pilus function. Infection and immunity. 2005;73(12):7922-31. [DOI:10.1128/IAI.73.12.7922-7931.2005] [PMID] [PMCID]
9. Asikyan ML, Kus JV, Burrows LL. Novel proteins that modulate type IV pilus retractiondynamics in Pseudomonas aeruginosa. Journal of bacteriology. 2008;190(21):7022-34. [DOI:10.1128/JB.00938-08] [PMID] [PMCID]
10. Saderi H, Lotfalipour H, Owlia P, Salimi H. Detection of Metallo-β-Lactamase producing pseudomonas aeruginosa isolated from burn patients in Tehran, Iran. Lab Medicine. 2010;41(10):609-12. [DOI:10.1309/LMQJF9J3T2OAACDJ]
11. Ranjbar R, Owlia P, Saderi H, Mansouri S, Jonaidi-Jafari N, Izadi M, et al. Characterization of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from burned patients hospitalized in a major burn center in Tehran, Iran. Acta Medica Iranica. 2011;49(10):675-9.
12. Boujari Nasrabadi MR, Hajia M. Multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa strains in Tehran Reference Burn Hospital, Tehran, Iran. African Journal of Microbiology Research 2012; 6(7):1393-6. [DOI:10.5897/AJMR11.1048]
13. Cohen-Cymberknoh M, Gilead N, Gartner S, Rovira S, Blau H, Mussaffi H, et al. Eradication failure of newly acquired Pseudomonas aeruginosa isolates in cystic fibrosis. Journal of Cystic Fibrosis. 2016: 15(6): 776-782. [DOI:10.1016/j.jcf.2016.04.006] [PMID]
14. Schwartz T, Volkmann H, Kirchen S, Kohnen W, Schon-Holz K, Jansen B, et al. Real-time PCR detection of Pseudomonas aeruginosa in clinical and municipal wastewater and genotyping of the ciprofloxacin-resistant isolates. FEMS microbiology ecology. 2006; 57(1):158-67. [DOI:10.1111/j.1574-6941.2006.00100.x] [PMID]
15. Basso P, Ragno M, Elsen S, Reboud E, Golovkine G, Bouillot S, et al. Pseudomonas aeruginosa Pore-Forming Exolysin and Type IV Pili Cooperate To Induce Host Cell Lysis. American society for microbiology. 2017; 8(1): e02250-16. [DOI:10.1128/mBio.02250-16] [PMID] [PMCID]
16. Streeter K, Katouli M. Pseudomonas aeruginosa: A review of their Pathogenesis and Prevalence in Clinical Settings and the Environment. Infect Epidemiol Med. 2016; 2(1): 25-32. DOI: 10.18869/m odares.iem.2.1.25 [DOI:10.18869/modares.iem.2.1.25]
17. Allison TM, Conrad S, Castric P. The group I pilin glycan affects type IVa pilus hydrophobicity and twitching motility in Pseudomonas aeruginosa 1244. Microbiology. 2015; 161(9): 1780-1789. [DOI:10.1099/mic.0.000128] [PMID] [PMCID]
18. Kus J. Diversity of Pseudomonas aeruginosa type IV pilins and identification of a novel D-arabinofuranose post-translational modification. 2008. (Doctoral dissertation).
19. Deligianni E, Pattison S, Berrar D, Ternan NG, Haylock RW, Moore JE, et al. Pseudomonas aeruginosa Cystic Fibrosis isolates of similar RAPD genotype exhibit diversity in biofilm forming ability in vitro. BMC Microbiology. 2010; 10(38): 1471-2180. [DOI:10.1186/1471-2180-10-38] [PMID] [PMCID]
20. Pirnay JP, Bilocq F, Pot B, Cornelis P, Zizi M, Van Eldere J, et al. Pseudomonas aeruginosa population structure revisited. PLoS ONE. 2009; 4(11): e7740. [DOI:10.1371/journal.pone.0007740] [PMID] [PMCID]
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |