سال 12، شماره 4 - ( مهر - آبان 1397 )                   جلد 12 شماره 4 صفحات 239-247 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tajbakhsh M, Zali M R, Fallah F. Phylogenetic Analysis of Salmonella spp. Isolated from Clinical Samples of Tehran's Hospitals Based on 23S rRNA Gene Sequence. Iran J Med Microbiol. 2018; 12 (4) :239-247
URL: http://ijmm.ir/article-1-839-fa.html
تاجبخش مرسده، زالی محمدرضا، فلاح فاطمه. بررسی فیلوژنی سویه‌های سالمونلای جدا‌شده از نمونه‌های بالینی بیمارستان‌های تهران براساس تعیین توالی ژن 23S rRNA . مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1397; 12 (4) :239-247

URL: http://ijmm.ir/article-1-839-fa.html


1- مرکز تحقیقات بیماری‌های منتقل از آب و غذا، پژوهشکده بیماری‌های گوارش و کبد دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران ، m_tajbakhsh@sbmu.ac.ir
2- مرکز تحقیقات بیماری‌های منتقل از آب و غذا، پژوهشکده بیماری‌های گوارش و کبد دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
3- مرکز تحقیقات عفونی اطفال، پژوهشکده سلامت کودکان، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
چکیده:   (2209 مشاهده)
زمینه و هدف: باکتری سالمونلا یکی از مهم‌ترین عوامل گاستروانتریت باکتریایی و بیماری‌های ناشی از غذا است. تاکنون بیش از ۲۵۰۰ سرووار از این جنس شناسایی‌شده که اکثر آنها برای انسان بیماری‌زا هستند. ساختار فیلوژنی خانواده انتروباکتریاسه براساس توالی ۱۶S rRNA تنوع وسیعی ندارد. بنابراین این ژن به دلیل میزان توالی بالای حفاظت‌شده در ساختار خود، نمی‌تواند مشکلات طبقه‌بندی را در گونه‌های نزدیک به هم حل کند. به این منظور برای بررسی سویه‌های سالمونلا، ژن ۲۳S rRNA انتخاب شد که توانایی تفکیک سویه‌های مرتبط به هم را در سطح زیرگونه دارد. هدف از این مطالعه بررسی قرابت سویه‌های سالمونلای بالینی با استفاده از توالی ژن ۲۳S rRNA است.
مواد و روش‌ کار: DNA نمونه‌های تأییدشده سالمونلا از بیماران با علائم گوارشی، استخراج و توالی ژن ۲۳S rRNA پس از PCR در آنها تعیین شد. درختچه فیلوژنی براساس روش Neighbor-joining و با نرم‌افزار MEGA ۵.۰۵ ۵ رسم شد.
یافته‌ها: دو ساختار مارپیچ ۲۵ و ۴۵ در بین اکثر سویه‌ها با سروتیپ‌های مختلف دیده شد. در سویه‌های سالمونلای تیفی تنها ساختار مارپیچ ۲۵ و در بقیه سویه‌ها مارپیچ ۴۵ مشاهده شد. میزان قرابت سویه‌های سالمونلا براساس توالی ۲۳S rRNA بین ۱۰۰-۹۹ درصد بود.
نتیجه‌گیری: نتایج ژن  ۲۳S rRNAتمایز بیشتری برای آنالیز در سطح زیرگونه و تفریق سروتیپ‌ها نشان می‌دهد. با توجه به تنوع سروتیپ‌های سالمونلا براساس تفاوت آنتی‌ژن‌های O و H سطحی، لزوم به‌کارگیری روش‌های نوین مولکولی در این راستا و جایگزینی آن با روش‌های سنتی ضروری به نظر می‌رسد.

 
واژه‌های کلیدی: سالمونلا، فیلوژنی، تعیین توالی، 23S rRNA
متن کامل [PDF 735 kb]   (304 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: میکروب شناسی مولکولی
دریافت: ۱۳۹۷/۳/۸ | پذیرش: ۱۳۹۷/۸/۲

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله میکروب شناسی پزشکی ایران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق   ناشر: موسسه فرنام

© 2019 All Rights Reserved | Iranian Journal of Medical Microbiology

Designed & Developed by : Yektaweb Publishr: Farname Inc.