[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: آرشیو مجله :: ارسال مقاله :: ثبت نام :: جستجو :: تماس با ما ::
:: سال 12، شماره 4 - ( مهر - آبان 1397 ) ::
جلد 12 شماره 4 صفحات 239-247 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی فیلوژنی سویه‌های سالمونلای جدا‌شده از نمونه‌های بالینی بیمارستان‌های تهران براساس تعیین توالی ژن 23S rRNA
مرسده تاجبخش1، محمدرضا زالی2، فاطمه فلاح3
1- مرکز تحقیقات بیماری‌های منتقل از آب و غذا، پژوهشکده بیماری‌های گوارش و کبد دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران ، m_tajbakhsh@sbmu.ac.ir
2- مرکز تحقیقات بیماری‌های منتقل از آب و غذا، پژوهشکده بیماری‌های گوارش و کبد دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
3- مرکز تحقیقات عفونی اطفال، پژوهشکده سلامت کودکان، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
چکیده:   (1704 مشاهده)
زمینه و هدف: باکتری سالمونلا یکی از مهم‌ترین عوامل گاستروانتریت باکتریایی و بیماری‌های ناشی از غذا است. تاکنون بیش از ۲۵۰۰ سرووار از این جنس شناسایی‌شده که اکثر آنها برای انسان بیماری‌زا هستند. ساختار فیلوژنی خانواده انتروباکتریاسه براساس توالی ۱۶S rRNA تنوع وسیعی ندارد. بنابراین این ژن به دلیل میزان توالی بالای حفاظت‌شده در ساختار خود، نمی‌تواند مشکلات طبقه‌بندی را در گونه‌های نزدیک به هم حل کند. به این منظور برای بررسی سویه‌های سالمونلا، ژن ۲۳S rRNA انتخاب شد که توانایی تفکیک سویه‌های مرتبط به هم را در سطح زیرگونه دارد. هدف از این مطالعه بررسی قرابت سویه‌های سالمونلای بالینی با استفاده از توالی ژن ۲۳S rRNA است.
مواد و روش‌ کار: DNA نمونه‌های تأییدشده سالمونلا از بیماران با علائم گوارشی، استخراج و توالی ژن ۲۳S rRNA پس از PCR در آنها تعیین شد. درختچه فیلوژنی براساس روش Neighbor-joining و با نرم‌افزار MEGA ۵.۰۵ ۵ رسم شد.
یافته‌ها: دو ساختار مارپیچ ۲۵ و ۴۵ در بین اکثر سویه‌ها با سروتیپ‌های مختلف دیده شد. در سویه‌های سالمونلای تیفی تنها ساختار مارپیچ ۲۵ و در بقیه سویه‌ها مارپیچ ۴۵ مشاهده شد. میزان قرابت سویه‌های سالمونلا براساس توالی ۲۳S rRNA بین ۱۰۰-۹۹ درصد بود.
نتیجه‌گیری: نتایج ژن  ۲۳S rRNAتمایز بیشتری برای آنالیز در سطح زیرگونه و تفریق سروتیپ‌ها نشان می‌دهد. با توجه به تنوع سروتیپ‌های سالمونلا براساس تفاوت آنتی‌ژن‌های O و H سطحی، لزوم به‌کارگیری روش‌های نوین مولکولی در این راستا و جایگزینی آن با روش‌های سنتی ضروری به نظر می‌رسد.

 
واژه‌های کلیدی: سالمونلا، فیلوژنی، تعیین توالی، 23S rRNA
متن کامل [PDF 735 kb]   (144 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: میکروب شناسی مولکولی
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tajbakhsh M, Zali M R, Fallah F. Phylogenetic Analysis of Salmonella spp. Isolated from Clinical Samples of Tehran's Hospitals Based on 23S rRNA Gene Sequence. Iran J Med Microbiol. 2018; 12 (4) :239-247
URL: http://ijmm.ir/article-1-839-fa.html

تاجبخش مرسده، زالی محمدرضا، فلاح فاطمه. بررسی فیلوژنی سویه‌های سالمونلای جدا‌شده از نمونه‌های بالینی بیمارستان‌های تهران براساس تعیین توالی ژن 23S rRNA . مجله میکروب شناسی پزشکی ایران. 1397; 12 (4) :239-247

URL: http://ijmm.ir/article-1-839-fa.html



سال 12، شماره 4 - ( مهر - آبان 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله میکروب شناسی پزشکی ایران Iranian Journal of Medical Microbiology
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 32 queries by YEKTAWEB 3876